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Observatório Europeu do Sul
Os parceiros oficiais de divulgação do Observatório Europeu do Sul (ESO) são membros de uma parceria exclusiva, que reconhece os esforços de instituições de educação informal, que colaboram regularmente em eventos e em projetos de divulgação ou educação informal do ESO.
O CAUP é um parceiro oficial de divulgação do ESO desde Novembro de 2012
Faculdade de Ciências da Universidade do Porto
A FCUP é a unidade orgânica da U.Porto responsável pela formação em Astronomia, tendo a funcionar graus de Astronomia em todos os ciclos de formação (1º, 2º e 3º).
Ao CAUP foi atribuído o estatuto de unidade de investigação parceira da FCUP em Setembro de 2010.
Centro de Astronomia e Astrofísica da Universidade de Lisboa
O CAAUL é uma unidade de I&D da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa em que se desenvolve investigacao em Astronomia, havendo ainda intervenção em projectos de instrumentação para a astronomia.
Em Maio de 2007 o CAUP subscreveu um memorandum de entendimento que prevê a cooperação activa em todas as áreas de intervenção de ambas as unidades.